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首先，当前，超过99%的陆地植物缺乏高质量的参考基因组，限制了人类对植物多样性、适应性及功能潜力的深入认知与应用开发。植物星球计划希望通过对缺乏参考基因组的目、科进行采样，借助系统发育基因组学方法，构建一个高分辨率、时间校准的完整陆地植物系统发育树，厘清主要植物类群之间的亲缘关系与分化时间，从而绘制完整的“植物生命之树”。
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